Рейтинг по показателям эффективности деятельности федеральных бюджетных и автономных образовательных учреждений высшего образования, подведомственных Министерству науки и высшего образования Российской Федерации, и работы их руководителей составляется с 2018 года на основании приказа Министерства образования и науки РФ. В 2019 году в него вошли 169 вузов, кроме находящихся на территории Москвы и Санкт-Петербурга.

Томский госуниверситет систем управления и радиоэлектроники и Александр Шелупанов (был ректором ТУСУРа на момент подачи отчёта) вошли во вторую лигу, набрав 60 баллов и заняв 6 – 8-е место общего рейтинга.

По трём показателям из шести ТУСУР можно отнести к первой лиге. Это такие показатели, как удельный вес численности иностранных студентов, темп прироста доходов от научно-исследовательских и опытно-конструкторских работ, а также количество цитирований публикаций, изданных за последние 5 лет, индексируемых в информационно-аналитических системах научного цитирования Web of Science и Scopus.

Согласно приказу Министерства образования и науки, для каждого вуза по каждому показателю эффективности начисляются баллы с учётом оценочных значений выполнения показателя. На основе множества сумм набранных баллов проводится ранжирование в порядке убывания набранных вузами баллов. Выделяется 5 лиг.